1、次级键secondary bond:除了典型的强化学键(共价键、离子键和金属键)等 ,依靠氢键以及弱的共价键和范德华作用力(即分子间作用力)相结合的各种分子内和分子间作用力的总称。
2、疏水键。疏水键是多肽链上的某些氨基酸的疏水基团或疏水侧链（非极性侧链），由于避开水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在维持蛋白质三级结构方面占有突出地位。
3、离子键。指阴离子，阳离子间通过静电作用形成的化学键。离子键属于化学键，大多数的盐，由碱金属或碱土金属形成的键，活泼金属氧化物都有离子键。含有离子键的化合物称为离子化合物。离子键与物体的熔沸点和硬度有关。
4、氢键 。氢原子与电负性大的原子X以共价键结合，若与电负性大、半径小的原子Y接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。
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